Rufy e compagni, che sono riusciti a penetrare nella Rotta Maggiore, partono alla volta del Regno di Alabasta assieme alla principessa Bibi per fermare la Baroque Works, una società segreta che intende impossessarsi del regno. Dopo aver conosciuto il medico Chopper sull’isola di Drum, i nostri giungono ad Alabasta. Venuti a sapere che la causa principale di quanto sta accadendo nel paese è Crocodile, partono in direzione di Rainbase, dove si trova quest’ultimo... Nel frattempo anche il re, per estirpare il male alla radice, si appresta ad inviare a Rainbase tutti i suoi soldati, ma all’improvviso giunge la notizia che i ribelli, ingannati dalla trasformazione di Mr. Two, si sono messi in marcia verso Alubarna, capitale del regno. Rufy non ha un istante da perdere e si affretta verso la capitale, quand’ecco che improvvisamente compare Crocodile. Tra i due comincia così un aspro confronto... Rufy viene sconfitto dai poteri del Frutto Sand Sand di Crocodile senza essere riuscito a fargli nemmeno una ferita, mentre ad Alubarna l’esercito reale e l’armata ribelle sono a un passo dallo scontrarsi. Bibi e compagni, nel tentativo di fermare la rivolta, riescono a far uscire allo scoperto Mr. One e gli altri Officer Agent, ma la rivolta non si ferma e i due eserciti giungono infine allo scontro. Commossi dal disperato tentativo di Bibi di porre fine al massacro, Zoro e gli altri si battono sino allo stremo delle forze...